男性の場合、尿道炎の症状が最も多く、排尿痛、 尿道から液体（ウミのようなもの）の分泌があり、尿道不快感などの自覚症状がある。
また、副睾丸が腫れるてくる事もあります。症状が出るまでの潜伏期間は１〜4週間です。感染しても半数の方は症状がでない事もあります。

女性の場合、ほとんどの人は感染しても自覚症状ない。
子宮頸管炎（炎症が腹腔内に及び、卵管や卵巣に子宮付属器炎を発症。将来的に卵管性不妊症の原因となる事もある）、骨盤内付属器炎（発熱、下腹部痛）、肝周囲炎（急性の極めて激しい痛み）。おりものの増加など。

母体が感染したままだと、産道を介して新生児が産道感染し、新生児がクラミジア感染してしまう可能性があります。早期に治療を受ける事が必要になります。
新生児結膜炎は、症状の悪化により失明する事もあり要注意。生後５日ぐらいから発症。粘性膿性眼脂、眼瞼腫脹、結膜充血、偽膜発生など。
新生児肺炎は、症状の悪化により死亡に至る事もあり、早めの治療が必要。生後3０日ぐらいから発症。鼻水、せき、多呼吸など。

診断と治療

病院での診断は、分泌物の採取や、尿から病原体を検出します。抗生物質を2週間ほど服用する事で直ります。（症状が消えても服用中止などの自己判断は危険です、必ず医師の指示に従うこと）お互いに感染させるピンポン感染があるため、治療を同時に行うことも必要になります。
もし、自然に治癒しても放置せず必ず医療機関にて検査するようにしましょう。